最终，小樱终于失望地知道，这个使用着鸣人的身体行走江湖的家伙，的确就是鸣人的父亲，四代火影波风水门。而真正的鸣人，已经被神树给干掉了。
当初四代火影被神树秽土转生出来的时候，神树为了给四代火影公平一战的机会，向他证明就算他四代火影有气运护体，神树可以完全碾压全盛时期的他，同时也为了绝对控制住四代，所以神树使用了地狱蝶分身作为召唤四代的祭品。
神树的地狱蝶是他特别制造出来的，它具有很特殊的能力，几乎可以免疫所有的能量攻击，有点类似于传说中巨龙一样的魔法免疫体质，就连神树的仙术魔贯光杀炮都伤不到它一丝一毫。也是因为这个原因，神树才可以利用地狱蝶使用出无限连续魔贯光杀炮，而不用担心那些地狱蝶被自己的魔贯光杀炮轰成渣。
而四代火影之所以能够活下来，也是多亏了神树那具作为祭品将他转生出来的地狱蝶分身。依靠那具地狱蝶分身转生出来的四代火影，他不但带着自己所有的力量回归这个世界，更是继承了那具地狱蝶分身身体的部分能力。
连仙术魔贯光杀炮都可以免疫的地狱蝶，自然可以免疫天照之火了。虽然水门只是获得了地狱蝶一部分的能力，并不能像地狱蝶一样可以完全免疫天照之火，但他终究是对天照之火有了一些免疫力，这就使得水门的灵魂在那个空间中坚持的时间久了一些。
久到神树将鸣人给干掉的时候，水门的灵魂依旧顽强的存在着。并且他还抓住了霜之哀霜封印鸣人灵魂的之时，那处空间被打开一丝裂缝的瞬间，使用了空间忍术从那处裂缝逃出了霜之哀伤的剑内空间。
至于之后的事情嘛！答应帮助神树炼化四代火影灵魂的雏田，因为神树干掉了鸣人，她到现在依旧在纠结该怎样处置鸣人的灵魂，所以她根本就没有那功夫再去注意那个四代火影，她也不知道四代火影已经逃跑了。因此直到四代再次出现之前，神树都不知道四代已经逃出了他的霜之哀伤。
不过就算不知道这其中的曲折，见到四代火影以鸣人的身躯再度复活，神树也忍不住吐槽这家伙不愧是他认为的这个时代真正的主角，四代火影这主角气运的确是要逆天了。遭遇神树这么猥琐的敌人，都已经将他的灵魂抓住并封印起来，四代火影竟然还可以复活过来。神树也只能望着四代火影的身影轻声说道“这根本就不符合科学！”。
看到已经死去的鸣人再度出现在战场，神树自然会对他特别关注了，神树的六识都是极其敏锐的，虽然他距离鸣人与小樱很远，但是以他的听力还是听到了四代火影对小樱的话，所以神树知道这个‘鸣人’的真实身份，知道他就是四代火影。
当初波风水门的灵魂逃离霜之哀伤的剑体空间之后，他第一眼看到的就是那个被神树一招杀死的鸣人，那种熟悉的感觉以及他身上还残留的九尾查克拉告诉水门，那个少年就是他的儿子，鸣人！
见到鸣人被神树杀死的场景，水门自然是对神树心生怨念，但是他却又无可奈何。神树实在是太强了，就算是全盛时期的自己都不是他的对手，更何况是现在只剩下灵魂的自己呢！他根本就什么都做不了。
然而就在那个时候，纲手等五影赶到了这处战场，在见到纲手的瞬间，水门突然间想起，他其实并不是什么事情都做不了，这种情况下还有一个忍术可以帮助现在的他，那就是当年加藤断闻名忍界的灵化术！
灵化术，加藤断因为这个忍术的而闻名忍界，这个忍术可以将自己灵化成活的灵魂，并让自己的灵魂进入他人的精神世界来控制他人的身体。神树将紫苑、雏田炼化为灵体的那个炼器之术，就有参考加藤断的灵化术。作为四代火影的波风水门也曾经研究过这个术，并有修炼过。
如今作为灵魂体的水门依旧可以使用这个术，于是他施展起灵化术进入到了刚刚死去的鸣人的精神世界，取代鸣人控制住了他的身体。在鸣人体内复活的四代火影并没有马上就跳起来跟神树拼命。他毕竟不是鸣人那个脑袋缺根弦的家伙，作为火影的他懂得用自己的脑袋去思考问题。
水门很清楚的知道，神树的强大并不是他可以抗衡的，所以，他需要找到强力的帮手，他将注意打到了控制着秽土转生军团的药师兜身上，并在战局混乱之时使用空间忍术悄悄离开了这处战场。
水门知道神树的实力很强，光是依靠他自己，再加上忍者联军的力量也很难从神树的手上取胜，他们需要更多的高端战力，于是水门想要利用药师兜将初代到三代火影都秽土转生出来。尸鬼封尽已经被神树破除了，并不知道这一点的药师兜并没有试图通灵过那三个火影，但是现在，水门需要他这么做。
脱离战场的水门最终如愿的找到了药师兜，并且将他打败，水门也在那里遇见了宇智波佐助。眼见鸣人出现在自己的眼前，已经换上鼬的眼睛的佐助，此时正是想要验证自己实力的时候，于是佐助不由分说与四代火影展开大战。
不过这场战斗并没有分出胜负就已经结束，四代火影告诉了佐助鸣人已死的事情，并劝说佐助与自己一同去对付神树，在这一刻，四代火影的主角光环终于显现出它的无敌力量，几乎没有费什么劲，四代火影就白捡了佐助这么一个强大战力。
之后，为了聚集更加强大的力量对付神树，佐助更是将大蛇丸复活出来，并让他秽土转生出了剩下的三个火影，至此，火影军团终于集结，初代到四代火影组团成功，已经拉齐了队伍的四代火影，也决定了带着自己的小伙伴们去刷神树这只Boss。..
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